网站包含违规链接会被惩罚吗，个人认为主要牵扯到以下几个方面：

1）、违规链接的数量

少量的违规链接很难引起搜索引擎的注意，除非是有人举报。

2）、违规链接的主动性与被动性

如果违规链接出现在文章中，那么这个违规链接就会被搜索引擎定义为主动性违规链接，因为编辑文章的主动权在你手里。如果违规链接出现在评论（留言）中，那么这个链接就会被搜索引擎定义为被动型违规链接，因为留言和评论的控制权不完全在你手里。

个人猜测：主动性违规链接更容易受到搜索引擎的惩罚。

3）、违规链接的锚文本设置

若是违规链接以锚文本的形式出现，且锚文本是违规词，受到惩罚的概率会更高，若锚文本不是违规词，只是链接到违规站点，受到惩罚的概率会低一些。

4）、违规链接是否遭到举报

遭到举报的违规链接会更快受到惩罚。

5）、违规链接的性质

违规链接性质越恶劣，受到的惩罚就越重，且不易恢复。

6）、网站权重高低

高权重的网站纵使存在违规链接，也不会受到惩罚。